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第3回ケモインフォマティクス入門講座 (第12 回情報化学入門講座)

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講義会場は  北里大学薬学部白金キャンパス 新2号館2201大講義室 です。(4月27日更新)

定員に達したため受付を終了しました。(4月27日更新)

キャンセルが生じたため追加募集を行います。(4月27日更新)

定員に達したため受付を終了しました。キャンセル等で空きが出た場合には本ページにてお知らせします。(3月25日更新)

定員50名。残席僅か。ご検討中の方はお早めにお申込み下さい。(3月17日更新)

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第3回ケモインフォマティクス入門講座(第12 回情報化学入門講座)
計算化学初心者のための分子動力学計算講習会
~計算環境の構築と失敗しないための考え方~

主催: 公益社団法人 日本化学会 情報化学部会
協賛: CACフォーラム

会期: 2016年5月21日(土)10時~17時
会場: 北里大学薬学部白金キャンパス (東京都港区白金5-9-1)*会場の詳細は追って連絡します

企画:北里大学 山﨑 広之(実行委員長)・吉田 智喜、東京大学 金子 弘昌・田中 雅人、近畿大学 中村 真也

■ 企画趣旨および内容
 分子動力学(MD)計算は、タンパク質のような生体高分子の動的な挙動やタンパク質薬物間などの物質間の相互作用を分子レベルでシミュレーションすることで推定する手法であり、スーパーコンピュータ「京」をはじめとした計算機サーバによる大規模計算も多く行われています。MD計算は、個々の研究対象の分子レベルの挙動を可視化し直感的な知見が得られるという半面、生物物理化学・情報科学の様々な分野の理論式や経験則・パラメータに基づくため、実際の計算の実行はボタン一つで終わるような気軽に行えるものではありません。

 本入門講座では、MD計算に興味は持っていても、「どんなツールを使ったらいいのか」「計算の実行は出来たけど本当にこれが妥当なのか」などの様々な不安や疑問を持つ初学者を主な対象に、計算機サーバなどを使わずWindowsPCを使って「お手軽に」MD計算と解析ができるような環境作りと演習を行います。演習では、計算実行前に重要となるモデリングや前処理、計算終了後の基本的な解析方法について実習を行います。

■ プログラム
 10:00-12:00 MD計算の環境設定および各ツールの基本的な演習
 13:00-17:00 MD計算の考え方と実践演習
                    講師:中村 真也(近畿大学薬学部)

 午前中は、各ツールの基本的な使用方法・必要最低限のコマンド操作への習熟を行います。午後はMD計算ツールGROMACSのチュートリアルのいくつかをベースに、失敗しないための考え方と解説を交えながら、系の構築から条件設定や基本的な解析の一連の流れで演習を行います。適時休憩を取りながら進めます。

 注) 各ツールが事前に自分でインストールでき、特に操作に問題を感じない方は、午後からの参加でも構いません。
 注) ご自身のノートパソコンを用いて演習を行います。当日はノートパソコンをご持参ください。申込者には後日、事前にデータのダウンロード先をメールにてご連絡致します。必ずダウンロードした後に参加してください。
 注) 本講座はWindowsPCでの実施を想定しています。Macintoshでは、構造の確認と計算結果の解析は可能ですが、簡便な計算実行環境の構築のためのツールが非対応のため、計算の実行が行えません。あらかじめご承知置きください。(考え方や注意点は問題なく学習できます。)
 注) 無線LAN(IEEE 802.11abg)および有線LANの環境を準備する予定です。

■ 参加費:
  正部会員(一般)および正部会員(学生):無料
  非部会員(一般):3,000 円
  非部会員(学生):1,000 円

 注) いずれもテキスト代含む
 注) 新たに部会員として入会された方も参加費は無料になります。
   さらに第2, 4回ケモインフォマティクス入門講座も参加費が無料になります。
   これを機会に入会をご検討下さい。なお第2回は5月14日(土)に量子化学計算入門
   第4回は5月29日(日)にケモメトリックス入門の内容で開催されます。あわせてご参加ご検討下さい。
   入会は部会ウェブサイトからお願いします。http://cicsj.chemistry.or.jp/

■ 参加申込:
 申込フォームよりお申込頂き、開催日の2 週間前迄に指定口座へお振込下さい。
 申込締切:2016年5月6日(金) ※定員になり次第締切(10名より催行)
 申込フォームURL:https://event.csj.jp/form/view.php?id=131341
 振込先口座:みずほ銀行神田支店 普通 1073505 名義:社団法人日本化学会
 注) 請求書ご希望の場合、参加登録完了通知メール記載のURLからダウンロードが出来ますので、そちらをご使用ください。

■ 問い合わせ先:
 公益社団法人日本化学会 情報化学部会 鷺谷/河瀬
 電話: 03-3292-6163 E-mail: cicsj@chemistry.or.jp

会期 2016年5月21日(土)10時~17時
行事名 第3回ケモインフォマティクス入門講座 (第12 回情報化学入門講座)
会場 北里大学薬学部白金キャンパス
連絡先 公益社団法人日本化学会 情報化学部会 鷺谷/河瀬
電話: 03-3292-6163 E-mail: cicsj@chemistry.or.jp
URL https://event.csj.jp/form/view.php?id=131341